BioC 2.0: Multiple platform build/check report

This page was generated on 2006-12-12 11:51:23 -0700 (Tue, 12 Dec 2006).

This is the "Multiple platform build/check report" for BioC 2.0:
 - Snapshot Date: 2006-12-12 00:12:43 -0700 (Tue, 12 Dec 2006)
 - URL: https://hedgehog.fhcrc.org/bioconductor/trunk/madman/Rpacks
 - Revision: 21434
 - Last Changed Date: 2006-12-11 21:54:09 -0800 (Mon, 11 Dec 2006)

Hostname OS Arch (*) Platform label (**) R version Installed pkgs
gopher5 Linux (SUSE 9.2) x86_64 x86_64-suse-linux 2.5.0 Under development (unstable) (2006-12-05 r40126) 359
lamb1 Linux (SUSE 10.1) x86_64 x86_64-suse-linux 2.5.0 Under development (unstable) (2006-12-05 r40126) 361
wellington Linux (SUSE 9.2) i686 i586-suse-linux 2.5.0 Under development (unstable) (2006-12-05 r40126) 354
churchill Solaris 2.9 sparc sparc-sun-solaris2.9 2.5.0 Under development (unstable) (2006-12-05 r40126) 346
lemming Windows Server 2003 x86_64 mingw32 2.5.0 Under development (unstable) (2006-12-05 r40126) 339
liverpool Windows Server 2003 NA mingw32 2.5.0 Under development (unstable) (2006-12-05 r40126) 338
derby Mac OS X (10.4.6) i686 i686-apple-darwin8 2.5.0 Under development (unstable) (2006-10-21 r39702) 345
Click on any hostname to see more info about the system (e.g. compilers)      (*) as reported by 'uname -p', except on Windows      (**) as reported by 'gcc -v'
Status meaning
 -  TIMEOUT  BUILD, CHECK or BUILD BIN of package took more than 40 minutes
 -  ERROR  BUILD, CHECK or BUILD BIN of package returned an error
 -  WARNINGS  CHECK of package produced warnings
 -  OK  BUILD, CHECK or BUILD BIN of package was OK
 - skipped CHECK or BUILD BIN of package was skipped because the BUILD step failed (or because something bad happened with the Build System itself)

Click on any glyph below to see the complete command output.

SUMMARYOSArchBUILDCHECKBUILD BIN
gopher5 Linux (SUSE 9.2) x86_64
028180
01247121
lamb1 Linux (SUSE 10.1) x86_64
027181
01150120
wellington Linux (SUSE 9.2) i686
038170
01643111
churchill Solaris 2.9 sparc
041167
01839110
lemming Windows Server 2003 x86_64
143164
01937108
07157
liverpool Windows Server 2003 NA
271135
413100
07128
derby Mac OS X (10.4.6) i686
025183
02247114
Package 1/208OSArchBUILDCHECKBUILD BIN

ABarray

1.3.0

Yongming Andrew Sun		Linux (SUSE 9.2) x86_64 OK  WARNINGS 
Linux (SUSE 10.1) x86_64 OK  WARNINGS 
Linux (SUSE 9.2) i686 OK  WARNINGS 
Solaris 2.9 sparc OK  WARNINGS 
Windows Server 2003 x86_64 OK  WARNINGS  OK 
Windows Server 2003 NA ERROR skippedskipped
Mac OS X (10.4.6) i686 OK  WARNINGS 
Package 2/208OSArchBUILDCHECKBUILD BIN

aCGH

1.9.0

Jane Fridlyand		Linux (SUSE 9.2) x86_64 ERROR skipped
Linux (SUSE 10.1) x86_64 ERROR skipped
Linux (SUSE 9.2) i686 ERROR skipped
Solaris 2.9 sparc ERROR skipped
Windows Server 2003 x86_64 ERROR skippedskipped
Windows Server 2003 NA ERROR skippedskipped
Mac OS X (10.4.6) i686 ERROR skipped
Package 3/208OSArchBUILDCHECKBUILD BIN

adSplit

1.5.0

Claudio Lottaz		Linux (SUSE 9.2) x86_64 OK  OK 
Linux (SUSE 10.1) x86_64 OK  OK 
Linux (SUSE 9.2) i686 OK  OK 
Solaris 2.9 sparc OK  OK 
Windows Server 2003 x86_64 OK  OK  OK 
Windows Server 2003 NA ERROR skippedskipped
Mac OS X (10.4.6) i686 OK  OK 
Package 4/208OSArchBUILDCHECKBUILD BIN

affxparser

1.7.2

Kasper Daniel Hansen		Linux (SUSE 9.2) x86_64 OK  WARNINGS 
Linux (SUSE 10.1) x86_64 OK  WARNINGS 
Linux (SUSE 9.2) i686 OK  WARNINGS 
Solaris 2.9 sparc OK  WARNINGS 
Windows Server 2003 x86_64 OK  WARNINGS  OK 
Windows Server 2003 NA OK  ERROR  OK 
Mac OS X (10.4.6) i686 OK  WARNINGS 
Package 5/208OSArchBUILDCHECKBUILD BIN

affy

1.13.12

Rafael A. Irizarry		Linux (SUSE 9.2) x86_64 OK  WARNINGS 
Linux (SUSE 10.1) x86_64 OK  WARNINGS 
Linux (SUSE 9.2) i686 OK  WARNINGS 
Solaris 2.9 sparc OK  WARNINGS 
Windows Server 2003 x86_64 OK  WARNINGS  OK 
Windows Server 2003 NA OK  ERROR  OK 
Mac OS X (10.4.6) i686 OK  WARNINGS 
Package 6/208OSArchBUILDCHECKBUILD BIN

affycomp

1.11.0

Rafael A. Irizarry		Linux (SUSE 9.2) x86_64 OK  OK 
Linux (SUSE 10.1) x86_64 OK  OK 
Linux (SUSE 9.2) i686 OK  OK 
Solaris 2.9 sparc OK  OK 
Windows Server 2003 x86_64 OK  OK  OK 
Windows Server 2003 NA OK  ERROR  OK 
Mac OS X (10.4.6) i686 OK  OK 
Package 7/208OSArchBUILDCHECKBUILD BIN

affycoretools

1.7.3

James W. MacDonald		Linux (SUSE 9.2) x86_64 ERROR skipped
Linux (SUSE 10.1) x86_64 ERROR skipped
Linux (SUSE 9.2) i686 ERROR skipped
Solaris 2.9 sparc ERROR skipped
Windows Server 2003 x86_64 ERROR skippedskipped
Windows Server 2003 NA ERROR skippedskipped
Mac OS X (10.4.6) i686 OK  WARNINGS 
Package 8/208OSArchBUILDCHECKBUILD BIN

affyio

1.3.1

Benjamin Milo Bolstad		Linux (SUSE 9.2) x86_64 OK  OK 
Linux (SUSE 10.1) x86_64 OK  OK 
Linux (SUSE 9.2) i686 OK  OK 
Solaris 2.9 sparc OK  OK 
Windows Server 2003 x86_64 OK  OK  OK 
Windows Server 2003 NA OK  ERROR  OK 
Mac OS X (10.4.6) i686 OK  OK 
Package 9/208OSArchBUILDCHECKBUILD BIN

affylmGUI

1.9.0

Keith Satterley		Linux (SUSE 9.2) x86_64 OK  OK 
Linux (SUSE 10.1) x86_64 OK  OK 
Linux (SUSE 9.2) i686 OK  OK 
Solaris 2.9 sparc OK  OK 
Windows Server 2003 x86_64 OK  OK  OK 
Windows Server 2003 NA OK  TIMEOUT  OK 
Mac OS X (10.4.6) i686 OK  OK 
Package 10/208OSArchBUILDCHECKBUILD BIN

affypdnn

1.9.2

Laurent		Linux (SUSE 9.2) x86_64 OK  WARNINGS 
Linux (SUSE 10.1) x86_64 OK  WARNINGS 
Linux (SUSE 9.2) i686 OK  WARNINGS 
Solaris 2.9 sparc OK  WARNINGS 
Windows Server 2003 x86_64 OK  WARNINGS  OK 
Windows Server 2003 NA OK  ERROR  OK 
Mac OS X (10.4.6) i686 OK  WARNINGS 
Package 11/208OSArchBUILDCHECKBUILD BIN

affyPLM

1.11.10

Ben Bolstad		Linux (SUSE 9.2) x86_64 ERROR skipped
Linux (SUSE 10.1) x86_64 ERROR skipped
Linux (SUSE 9.2) i686 ERROR skipped
Solaris 2.9 sparc ERROR skipped
Windows Server 2003 x86_64 ERROR skippedskipped
Windows Server 2003 NA ERROR skippedskipped
Mac OS X (10.4.6) i686 ERROR skipped
Package 12/208OSArchBUILDCHECKBUILD BIN

affyQCReport

1.13.14

Craig Parman		Linux (SUSE 9.2) x86_64 ERROR skipped
Linux (SUSE 10.1) x86_64 ERROR skipped
Linux (SUSE 9.2) i686 ERROR skipped
Solaris 2.9 sparc ERROR skipped
Windows Server 2003 x86_64 ERROR skippedskipped
Windows Server 2003 NA ERROR skippedskipped
Mac OS X (10.4.6) i686 ERROR skipped
Package 13/208OSArchBUILDCHECKBUILD BIN

altcdfenvs

1.9.0

Laurent Gautier		Linux (SUSE 9.2) x86_64 OK  OK 
Linux (SUSE 10.1) x86_64 OK  OK 
Linux (SUSE 9.2) i686 OK  OK 
Solaris 2.9 sparc OK  OK 
Windows Server 2003 x86_64 OK  OK  OK 
Windows Server 2003 NA OK  ERROR  OK 
Mac OS X (10.4.6) i686 OK  OK 
Package 14/208OSArchBUILDCHECKBUILD BIN

annaffy

1.7.0

Colin A. Smith		Linux (SUSE 9.2) x86_64 ERROR skipped
Linux (SUSE 10.1) x86_64 ERROR skipped
Linux (SUSE 9.2) i686 ERROR skipped
Solaris 2.9 sparc ERROR skipped
Windows Server 2003 x86_64 ERROR skippedskipped
Windows Server 2003 NA ERROR skippedskipped
Mac OS X (10.4.6) i686 OK  OK 
Package 15/208OSArchBUILDCHECKBUILD BIN

AnnBuilder

1.13.9

J. Zhang		Linux (SUSE 9.2) x86_64 OK  OK 
Linux (SUSE 10.1) x86_64 OK  OK 
Linux (SUSE 9.2) i686 OK  OK 
Solaris 2.9 sparc OK  OK 
Windows Server 2003 x86_64 OK  OK  OK 
Windows Server 2003 NA OK  ERROR  OK 
Mac OS X (10.4.6) i686 OK  OK 
Package 16/208OSArchBUILDCHECKBUILD BIN

annotate

1.13.3

Biocore Team		Linux (SUSE 9.2) x86_64 OK  OK 
Linux (SUSE 10.1) x86_64 OK  OK 
Linux (SUSE 9.2) i686 OK  OK 
Solaris 2.9 sparc OK  OK 
Windows Server 2003 x86_64 OK  OK  OK 
Windows Server 2003 NA OK  ERROR  OK 
Mac OS X (10.4.6) i686 OK  OK 
Package 17/208OSArchBUILDCHECKBUILD BIN

AnnotationDbi

0.0.8

Biocore Team		Linux (SUSE 9.2) x86_64 OK  WARNINGS 
Linux (SUSE 10.1) x86_64 OK  WARNINGS 
Linux (SUSE 9.2) i686 OK  WARNINGS 
Solaris 2.9 sparc OK  ERROR 
Windows Server 2003 x86_64 OK  WARNINGS  OK 
Windows Server 2003 NA OK  ERROR  OK 
Mac OS X (10.4.6) i686 OK  WARNINGS 
Package 18/208OSArchBUILDCHECKBUILD BIN

apComplex

2.0.0

Denise Scholtens		Linux (SUSE 9.2) x86_64 OK  OK 
Linux (SUSE 10.1) x86_64 OK  OK 
Linux (SUSE 9.2) i686 ERROR skipped
Solaris 2.9 sparc ERROR skipped
Windows Server 2003 x86_64 OK  OK  OK 
Windows Server 2003 NA OK  ERROR  OK 
Mac OS X (10.4.6) i686 OK  WARNINGS 
Package 19/208OSArchBUILDCHECKBUILD BIN

applera

1.5.0

Francesca Cordero		Linux (SUSE 9.2) x86_64 ERROR skipped
Linux (SUSE 10.1) x86_64 ERROR skipped
Linux (SUSE 9.2) i686 ERROR skipped
Solaris 2.9 sparc ERROR skipped
Windows Server 2003 x86_64 ERROR skippedskipped
Windows Server 2003 NA ERROR skippedskipped
Mac OS X (10.4.6) i686 OK  WARNINGS 
Package 20/208OSArchBUILDCHECKBUILD BIN

arji

0.3.10

Vince Carey		Linux (SUSE 9.2) x86_64 OK  WARNINGS 
Linux (SUSE 10.1) x86_64 OK  WARNINGS 
Linux (SUSE 9.2) i686 OK  WARNINGS 
Solaris 2.9 sparc ERROR skipped
Windows Server 2003 x86_64 ERROR skippedskipped
Windows Server 2003 NA ERROR skippedskipped
Mac OS X (10.4.6) i686 ERROR skipped
Package 21/208OSArchBUILDCHECKBUILD BIN

aroma.light

1.3.0

Henrik Bengtsson		Linux (SUSE 9.2) x86_64 OK  WARNINGS 
Linux (SUSE 10.1) x86_64 OK  WARNINGS 
Linux (SUSE 9.2) i686 OK  WARNINGS 
Solaris 2.9 sparc OK  WARNINGS 
Windows Server 2003 x86_64 OK  WARNINGS  OK 
Windows Server 2003 NA OK  ERROR  OK 
Mac OS X (10.4.6) i686 OK  WARNINGS 
Package 22/208OSArchBUILDCHECKBUILD BIN

arrayMagic

1.13.0

Andreas Buness		Linux (SUSE 9.2) x86_64 OK  OK 
Linux (SUSE 10.1) x86_64 OK  OK 
Linux (SUSE 9.2) i686 OK  OK 
Solaris 2.9 sparc OK  OK 
Windows Server 2003 x86_64 OK  OK  OK 
Windows Server 2003 NA ERROR skippedskipped
Mac OS X (10.4.6) i686 OK  OK 
Package 23/208OSArchBUILDCHECKBUILD BIN

arrayQCplot

2.3.0

Eun-kyung Lee		Linux (SUSE 9.2) x86_64 OK  ERROR 
Linux (SUSE 10.1) x86_64 OK  OK 
Linux (SUSE 9.2) i686 OK  ERROR 
Solaris 2.9 sparc OK  ERROR 
Windows Server 2003 x86_64 OK  ERROR  ERROR 
Windows Server 2003 NA OK  ERROR  ERROR 
Mac OS X (10.4.6) i686 OK  ERROR 
Package 24/208OSArchBUILDCHECKBUILD BIN

arrayQuality

1.11.0

A. Paquet		Linux (SUSE 9.2) x86_64 OK  OK 
Linux (SUSE 10.1) x86_64 OK  OK 
Linux (SUSE 9.2) i686 OK  OK 
Solaris 2.9 sparc OK  OK 
Windows Server 2003 x86_64 OK  OK  OK 
Windows Server 2003 NA OK  ERROR  OK 
Mac OS X (10.4.6) i686 OK  OK 
Package 25/208OSArchBUILDCHECKBUILD BIN

beadarray

1.3.0

Mark Dunning		Linux (SUSE 9.2) x86_64 OK  WARNINGS 
Linux (SUSE 10.1) x86_64 OK  WARNINGS 
Linux (SUSE 9.2) i686 OK  WARNINGS 
Solaris 2.9 sparc OK  ERROR 
Windows Server 2003 x86_64 OK  WARNINGS  OK 
Windows Server 2003 NA OK  ERROR  OK 
Mac OS X (10.4.6) i686 OK  WARNINGS 
Package 26/208OSArchBUILDCHECKBUILD BIN

beadarraySNP

1.1.8

Jan Oosting		Linux (SUSE 9.2) x86_64 OK  WARNINGS 
Linux (SUSE 10.1) x86_64 OK  WARNINGS 
Linux (SUSE 9.2) i686 OK  WARNINGS 
Solaris 2.9 sparc OK  WARNINGS 
Windows Server 2003 x86_64 OK  WARNINGS  OK 
Windows Server 2003 NA OK  ERROR  OK 
Mac OS X (10.4.6) i686 OK  WARNINGS 
Package 27/208OSArchBUILDCHECKBUILD BIN

BeadExplorer

1.1.3

Gareth Elvidge		Linux (SUSE 9.2) x86_64 OK  WARNINGS 
Linux (SUSE 10.1) x86_64 OK  WARNINGS 
Linux (SUSE 9.2) i686 OK  WARNINGS 
Solaris 2.9 sparc OK  WARNINGS 
Windows Server 2003 x86_64 OK  WARNINGS  OK 
Windows Server 2003 NA OK  TIMEOUT  OK 
Mac OS X (10.4.6) i686 OK  WARNINGS 
Package 28/208OSArchBUILDCHECKBUILD BIN

bim

1.7.0

Brian S. Yandell		Linux (SUSE 9.2) x86_64 ERROR skipped
Linux (SUSE 10.1) x86_64 ERROR skipped
Linux (SUSE 9.2) i686 ERROR skipped
Solaris 2.9 sparc ERROR skipped
Windows Server 2003 x86_64 ERROR skippedskipped
Windows Server 2003 NA ERROR skippedskipped
Mac OS X (10.4.6) i686 OK  OK 
Package 29/208OSArchBUILDCHECKBUILD BIN

Biobase

1.13.28

Biocore Team		Linux (SUSE 9.2) x86_64 OK  OK 
Linux (SUSE 10.1) x86_64 OK  OK 
Linux (SUSE 9.2) i686 OK  OK 
Solaris 2.9 sparc OK  OK 
Windows Server 2003 x86_64 OK  OK  OK 
Windows Server 2003 NA OK  ERROR  OK 
Mac OS X (10.4.6) i686 OK  OK 
Package 30/208OSArchBUILDCHECKBUILD BIN

biocViews

1.3.8

Seth Falcon		Linux (SUSE 9.2) x86_64 OK  OK 
Linux (SUSE 10.1) x86_64 OK  OK 
Linux (SUSE 9.2) i686 OK  OK 
Solaris 2.9 sparc OK  OK 
Windows Server 2003 x86_64 OK  OK  OK 
Windows Server 2003 NA OK  ERROR  OK 
Mac OS X (10.4.6) i686 OK  OK 
Package 31/208OSArchBUILDCHECKBUILD BIN

bioDist

1.7.1

Biocore Team		Linux (SUSE 9.2) x86_64 OK  OK 
Linux (SUSE 10.1) x86_64 OK  OK 
Linux (SUSE 9.2) i686 OK  OK 
Solaris 2.9 sparc OK  OK 
Windows Server 2003 x86_64 OK  OK  OK 
Windows Server 2003 NA OK  ERROR  OK 
Mac OS X (10.4.6) i686 OK  OK 
Package 32/208OSArchBUILDCHECKBUILD BIN

biomaRt

1.9.9

Steffen Durinck		Linux (SUSE 9.2) x86_64 OK  WARNINGS 
Linux (SUSE 10.1) x86_64 OK  WARNINGS 
Linux (SUSE 9.2) i686 OK  WARNINGS 
Solaris 2.9 sparc OK  WARNINGS 
Windows Server 2003 x86_64 ERROR skippedskipped
Windows Server 2003 NA ERROR skippedskipped
Mac OS X (10.4.6) i686 OK  WARNINGS 
Package 33/208OSArchBUILDCHECKBUILD BIN

BioMVCClass

1.3.0

Elizabeth Whalen		Linux (SUSE 9.2) x86_64 OK  OK 
Linux (SUSE 10.1) x86_64 OK  OK 
Linux (SUSE 9.2) i686 OK  ERROR 
Solaris 2.9 sparc OK  ERROR 
Windows Server 2003 x86_64 OK