Download stats for Bioconductor Software packagesDownload stats for Bioconductor annotation packages

Download stats for Bioconductor experiment packages

This page was generated on 2016-04-27 05:06:12 -0700 (Wed, 27 Apr 2016).

This page monitors Bioconductor experiment package downloads from http://bioconductor.org/ over the last 12 months. The number reported next to each package name is the number of distinct IPs that “hit” the package over the last 12 months.


Top 15

1ALL (12982)
2geneLenDataBase (5439)
3airway (5260)
4pasilla (5156)
5affydata (5006)
6golubEsets (3801)
7bladderbatch (2570)
8msdata (2474)
9faahKO (2257)
10gageData (2117)
11minfiData (2089)
12CLL (2002)
13parathyroidSE (1980)
14fission (1865)
15pasillaBamSubset (1857)

All experiment packages

MonthNb of distinct IPsNb of downloads
May/2015620922866
Jun/2015615325586
Jul/2015494520660
Aug/2015448721136
Sep/2015522122367
Oct/2015556329497
Nov/2015640531699
Dec/2015612330886
Jan/2016576928463
Feb/2016572626999
Mar/2016634433712
Apr/2016580430693
All months50481324564

A

a4Core (1)
a4Reporting (1)
ABAData (437)
affy (12)
affycompData (408)
affycoretools (1)
affydata (5006)
Affyhgu133A2Expr (299)
Affyhgu133aExpr (340)
Affyhgu133Plus2Expr (319)
affyio (12)
AffymetrixDataTestFiles (724)
Affymoe4302Expr (274)
Affymoe430Expr (5)
affyPLM (3)
AIMS (1)
airway (5260)
ALL (12982)
ALLMLL (1226)
AmpAffyExample (458)
AneuFinderData (13)
annotate (12)
AnnotationDbi (6)
AnnotationForge (1)
antiProfilesData (426)
arrayQualityMetrics (1)
ARRmData (886)
AshkenazimSonChr21 (87)
ASSET (1)

B

ballgown (1)
bcellViper (328)
beadarray (1)
beadarrayExampleData (590)
BeadArrayUseCases (606)
BeadDataPackR (1)
beta7 (455)
Biobase (42)
BiocInstaller (2)
BiocParallel (2)
biomaRt (1)
Biostrings (20)
biovizBase (5)
birta (5)
bladderbatch (2570)
blimaTestingData (209)
breastCancerMAINZ (602)
breastCancerNKI (709)
breastCancerTRANSBIG (461)
breastCancerUNT (435)
breastCancerUPP (450)
breastCancerVDX (1122)
bronchialIL13 (279)
BSgenome (9)
bsseqData (462)
bumphunter (2)

C

CAMERA (4)
cancerdata (302)
CardinalWorkflows (217)
Category (2)
CCl4 (454)
ccTutorial (249)
ceu1kg (207)
ceu1kgv (171)
ceuhm3 (217)
cgdv17 (580)
ChAMPdata (1791)
charmData (281)
cheung2010 (238)
chimera (1)
ChimpHumanBrainData (176)
ChIPComp (1)
chipenrich (1)
chipenrich.data (926)
ChIPQC (1)
chipseq (1)
ChIPseqR (1)
ChIPsim (1)
ChIPXpressData (820)
chopsticks (1)
chroGPS (1)
chromDraw (1)
ChromHeatMap (1)
cisPath (1)
cleanUpdTSeq (1)
cleaver (1)
clippda (1)
clipper (1)
CLL (2002)
Clomial (1)
Clonality (1)
clonotypeR (1)
clst (2)
clstutils (2)
clusterStab (1)
CMA (1)
cMap2data (1405)
cn.farms (1)
cn.mops (1)
CNAnorm (1)
CNEr (2)
CNORdt (1)
CNORfeeder (1)
CNORfuzzy (1)
CNORode (1)
CNPBayes (1)
CNTools (1)
cnvGSA (1)
cnvGSAdata (238)
CNVPanelizer (1)
CNVrd2 (1)
CNVtools (2)
cobindR (1)
CoCiteStats (1)
codelink (1)
CODEX (1)
CoGAPS (1)
cogena (1)
coGPS (1)
COHCAP (1)
COHCAPanno (981)
colonCA (487)
coMET (1)
COMPASS (1)
compcodeR (1)
CompGO (1)
ComplexHeatmap (1)
CONFESSdata (7)
ConnectivityMap (256)
ConsensusClusterPlus (2)
conumee (1)
convert (1)
copa (1)
COPDSexualDimorphism.data (1158)
CopyhelpeR (763)
copynumber (1)
CopyNumber450k (1)
CopyNumber450kData (318)
CopywriteR (1)
CoRegNet (1)
Cormotif (1)
CorMut (1)
coRNAi (1)
CORREP (1)
COSMIC.67 (259)
cosmiq (1)
COSNet (1)
cpvSNP (1)
cqn (1)
CRCL18 (141)
CRImage (1)
crlmm (1)
csaw (1)
CSSP (1)
ctc (1)
cummeRbund (5)
curatedBladderData (217)
curatedBreastData (166)
curatedCRCData (213)
curatedOvarianData (564)
customProDB (1)
cycle (1)
cytofkit (1)

D

dagLogo (1)
daMA (1)
DAPAR (1)
DAPARdata (6)
DART (1)
DASiR (1)
DAVIDQuery (1)
davidTiling (251)
DBChIP (1)
ddCt (1)
ddgraph (1)
DECIPHER (1)
DeconRNASeq (1)
DEDS (1)
deepSNV (1)
DEGraph (1)
DEGseq (2)
derfinderData (249)
DESeq (9)
DESeq2 (6)
DeSousa2013 (1036)
destiny (1)
dexus (1)
DFP (1)
DiffBind (3)
diffGeneAnalysis (1)
diffHic (1)
DiffLogo (1)
diffloopdata (4)
diggit (1)
diggitdata (167)
DirichletMultinomial (2)
dks (1)
DLBCL (562)
DmelSGI (140)
DMRcaller (1)
DMRcatedata (1169)
DMRforPairs (1)
DNABarcodes (1)
DNAcopy (4)
domainsignatures (1)
DonaPLLP2013 (147)
DOQTL (1)
DREAM4 (218)
dressCheck (185)
DriverNet (1)
DrugVsDisease (1)
DrugVsDiseasedata (886)
dsQTL (253)
DSS (1)
DTA (1)
dualKS (1)
DupChecker (1)
DvDdata (188)
dyebias (1)
dyebiasexamples (213)
DynDoc (1)

E

EasyqpcR (1)
EatonEtAlChIPseq (312)
EBarrays (1)
EBcoexpress (1)
EBImage (3)
EBSeq (3)
EBSeqHMM (1)
ecoliLeucine (409)
ecolitk (1)
EDDA (1)
edge (1)
edgeR (12)
EGSEAdata (4)
eisa (1)
ELBOW (1)
ELMER (1)
ELMER.data (444)
EMDomics (1)
ENCODEFig4Band4D (36)
encoDnaseI (204)
EnrichedHeatmap (1)
ensemblVEP (1)
ENVISIONQuery (1)
epigenomix (1)
erccdashboard (1)
erma (1)
estrogen (1372)
etec16s (6)
eudysbiome (1)
ExiMiR (1)
exomeCopy (1)
explorase (1)
ExpressionView (1)

F

faahKO (2257)
fabia (1)
fabiaData (238)
facopy.annot (679)
facsDorit (314)
factDesign (1)
FANTOM3and4CAGE (223)
farms (1)
fastseg (1)
fCI (1)
fdrame (1)
FEM (1)
ffpe (1)
ffpeExampleData (221)
FGNet (1)
fibroEset (1118)
FindMyFriends (1)
FIs (16)
FISHalyseR (1)
fission (1865)
flagme (2)
Fletcher2013a (223)
Fletcher2013b (224)
flipflop (1)
flowBeads (1)
flowBin (1)
flowcatchR (1)
flowCHIC (1)
flowCL (1)
flowClean (1)
flowClust (1)
flowCore (3)
flowCyBar (1)
flowDensity (1)
flowFit (1)
flowFitExampleData (196)
flowFP (1)
flowMap (1)
flowMatch (1)
flowMeans (1)
flowMerge (1)
flowPeaks (1)
flowPlots (1)
flowQB (1)
FlowRepositoryR (1)
FlowSOM (1)
FlowSorted.Blood.450k (891)
FlowSorted.CordBlood.450k (18)
FlowSorted.DLPFC.450k (160)
flowStats (1)
flowTrans (1)
flowType (1)
flowUtils (1)
flowViz (1)
flowVS (1)
flowWorkspace (3)
flowWorkspaceData (458)
fmcsR (1)
focalCall (1)
FourCSeq (1)
FRGEpistasis (1)
frma (1)
frmaExampleData (330)
frmaTools (1)
fucci (8)
FunciSNP (1)
FunciSNP.data (970)
furrowSeg (12)

G

gaga (1)
gage (1)
gageData (2117)
gaggle (1)
gaia (1)
gaschYHS (255)
gatingMLData (234)
gaucho (1)
gcatest (1)
gCMAP (1)
gCMAPWeb (1)
gcrma (9)
gcspikelite (853)
gdsfmt (2)
geecc (1)
genArise (1)
GENE.E (1)
GeneAnswers (1)
GeneBreak (1)
GeneExpressionSignature (1)
genefilter (13)
genefu (1)
geneLenDataBase (5439)
GeneMeta (1)
GeneNetworkBuilder (1)
GeneOverlap (1)
geneplotter (8)
geneRecommender (1)
GeneRegionScan (1)
geneRxCluster (1)
GeneSelectMMD (1)
GeneSelector (1)
GENESIS (1)
geNetClassifier (1)
GeneticsDesign (1)
GeneticsPed (1)
genoCN (1)
genomationData (337)
GenomeGraphs (1)
genomeIntervals (1)
GenomicAlignments (11)
GenomicFeatures (6)
GenomicFeatures.Hsapiens.UCSC.hg18 (19)
GenomicFeatures.Mmusculus.UCSC.mm9 (15)
GenomicRanges (19)
GenomicTuples (1)
Genominator (1)
genoset (2)
genotypeeval (1)
GenoView (1)
GEOmetadb (1)
GEOquery (10)
GEOsubmission (1)
gespeR (1)
GeuvadisTranscriptExpr (7)
geuvPack (696)
geuvStore (170)
geuvStore2 (18)
GEWIST (1)
GGBase (1)
ggbio (1)
GGdata (428)
ggtut (212)
globaltest (1)
GOFunction (1)
golubEsets (3801)
GOSemSim (4)
GOstats (3)
graph (14)
grndata (673)
GSBenchMark (153)
GSE62944 (12)
GSEABase (4)
gskb (198)
GSVAdata (606)
Gviz (2)
GWASdata (533)
GWASTools (1)

H

h5vcData (834)
hapmap100khind (210)
hapmap100kxba (315)
hapmap500knsp (203)
hapmap500ksty (190)
hapmapsnp5 (260)
hapmapsnp6 (468)
harbChIP (376)
HarmanData (7)
HD2013SGI (208)
healthyFlowData (207)
HEEBOdata (243)
hgu133abarcodevecs (189)
hgu133afrmavecs (39)
hgu133plus2barcodevecs (199)
hgu133plus2frmavecs (42)
hgu2beta7 (256)
HiCDataHumanIMR90 (251)
HiCDataLymphoblast (210)
Hiiragi2013 (339)
HIVcDNAvantWout03 (175)
hmyriB36 (233)
HSMMSingleCell (1698)
humanStemCell (527)

I

IHWpaper (2)
Illumina450ProbeVariants.db (1806)
IlluminaDataTestFiles (444)
IlluminaHumanMethylation450kmanifest (37)
illuminaio (3)
impute (12)
ind1KG (214)
intansv (1)
interactiveDisplayBase (2)
iontreeData (210)
IRanges (48)
ITALICSData (774)
Iyer517 (203)

J

JASPAR2014 (765)
JASPAR2016 (53)
JctSeqData (15)

K

KEGGandMetacoreDzPathwaysGEO (194)
KEGGdzPathwaysGEO (889)
KEGGgraph (2)
keggorthology (1)
KEGGprofile (1)
KEGGREST (1)
kidpack (363)

L

leeBamViews (1158)
leukemiasEset (960)
LiebermanAidenHiC2009 (237)
limma (29)
ListerEtAlBSseq (154)
lumi (2)
lumiBarnes (386)
LungCancerACvsSCCGEO (730)
LungCancerLines (285)
lungExpression (313)
lymphoma (14)

M

MafDb.ALL.wgs.phase1.release.v3.20101123 (18)
MafDb.ESP6500SI.V2.SSA137.dbSNP138 (26)
MAIT (1)
makecdfenv (1)
mammaPrintData (200)
mAPKLData (127)
maqcExpression4plex (378)
MAQCsubset (225)
MAQCsubsetAFX (241)
MAQCsubsetILM (216)
MEALData (77)
MEDIPSData (402)
MEEBOdata (216)
Metab (1)
metaMS (1)
metaMSdata (227)
methyAnalysis (1)
MethylAidData (135)
MethylMix (2)
methylumi (4)
minfi (3)
minfiData (2089)
minionSummaryData (73)
miRcompData (278)
miRNATarget (228)
mitoODEdata (653)
MMDiffBamSubset (214)
mosaicsExample (232)
mouse4302barcodevecs (166)
mouse4302frmavecs (37)
MSBdata (162)
msd16s (257)
msdata (2474)
MSnbase (1)
msqc1 (10)
mtbls2 (97)
MUGAExampleData (613)
Mulder2012 (200)
multtest (5)
mvoutData (218)
mzID (1)
mzR (3)

N

ncdfFlow (1)
NCIgraphData (209)
Neve2006 (227)
NGScopyData (196)
NOISeq (1)

O

oligo (1)
oligoClasses (3)
OmicCircos (3)
OrganismDbi (1)

P

parathyroid (88)
parathyroidSE (1980)
pasilla (5156)
pasillaBamSubset (1857)
PasillaTranscriptExpr (9)
PathNetData (233)
pcaGoPromoter.Hs.hg19 (213)
pcaGoPromoter.Mm.mm9 (203)
pcaGoPromoter.Rn.rn4 (206)
pcaMethods (1)
PCHiCdata (15)
pd.atdschip.tiling (208)
pepDat (155)
PGPC (15)
PGSEA (1)
phastCons100way.UCSC.hg19 (36)
polyester (1)
ppiData (985)
prebsdata (192)
PREDAsampledata (215)
preprocessCore (39)
ProData (303)
pRolocdata (1372)
prostateCancerCamcap (8)
prostateCancerGrasso (7)
prostateCancerStockholm (5)
prostateCancerTaylor (5)
prostateCancerVarambally (6)
ProtGenerics (4)
pumadata (292)
PWMEnrich.Dmelanogaster.background (277)
PWMEnrich.Hsapiens.background (323)
PWMEnrich.Mmusculus.background (236)

Q

QDNAseq.hg19 (83)
QDNAseq.mm10 (55)
QUBICdata (6)
qvalue (1)

R

RankProd (1)
RBGL (12)
rcellminerData (519)
ReportingTools (3)
rfcdmin (64)
RforProteomics (1162)
Rgraphviz (8)
rhdf5 (6)
rheumaticConditionWOLLBOLD (221)
RIPSeekerData (229)
RMassBankData (265)
RNAinteractMAPK (196)
RNAseqData.HeLa.bam.chr14 (55)
RNAseqData.HNRNPC.bam.chr14 (1491)
RNASeqDataSubset (43)
RnaSeqSampleSizeData (664)
RnaSeqTutorial (1080)
RnBeads (1)
RnBeads.hg19 (1051)
RnBeads.hg38 (88)
RnBeads.mm10 (205)
RnBeads.mm9 (211)
RnBeads.rn5 (154)
ROC (4)
Rqc (1)
RRBSdata (141)
rRDPData (149)
Rsamtools (16)
rsbml (1)
RTCGA.clinical (152)
RTCGA.CNV (12)
RTCGA.methylation (7)
RTCGA.miRNASeq (9)
RTCGA.mRNA (10)
RTCGA.mutations (117)
RTCGA.PANCAN12 (9)
RTCGA.rnaseq (160)
RTCGA.RPPA (10)
rtracklayer (20)
RUVnormalizeData (726)

S

S4Vectors (65)
SCLCBam (176)
seq2pathway (1)
seq2pathway.data (657)
seqc (335)
seqCNA.annot (736)
seqLogo (1)
serumStimulation (206)
seventyGeneData (190)
shinyMethylData (229)
ShortRead (2)
siggenes (2)
sigPathway (1)
simpIntLists (766)
simpleaffy (8)
Single.mTEC.Transcriptomes (14)
SNAData (265)
SNAGEEdata (704)
SNPhoodData (69)
SNPRelate (1)
SomatiCAData (152)
SomaticCancerAlterations (572)
spade (2)
SPIA (1)
SpikeIn (733)
SpikeInSubset (1717)
spliceR (1)
stemHypoxia (835)
stjudem (247)
SummarizedExperiment (2)
survcomp (2)
sva (2)
SVM2CRMdata (518)
synapterdata (539)
systemPipeRdata (159)

T

TargetScoreData (188)
TargetSearchData (240)
TBX20BamSubset (135)
TCGAcrcmiRNA (153)
TCGAcrcmRNA (172)
TCGAMethylation450k (339)
TFBSTools (1)
TimerQuant (48)
tinesath1cdf (190)
tinesath1probe (183)
tofsimsData (11)
topGO (3)
tweeDEseqCountData (638)
tximportData (56)

V

VariantAnnotation (11)
vsn (6)

W

wateRmelon (1)
waveTilingData (217)
WES.1KG.WUGSC (287)

X

xcms (3)
XhybCasneuf (203)
XVector (32)

Y

yeastCC (1296)
yeastExpData (951)
yeastGSData (169)
yeastNagalakshmi (356)
yeastRNASeq (1051)
yri1kgv (231)
yriMulti (11)

Z

zebrafishRNASeq (1135)
zlibbioc (54)