Download stats for Bioconductor annotation packagesDownload stats for Bioconductor experiment packages

Download stats for Bioconductor Software packages

This page was generated on 2015-03-02 05:57:42 -0800 (Mon, 02 Mar 2015).

This page monitors Bioconductor Software package downloads from http://bioconductor.org/ over the last 12 months. The number reported next to each package name is the number of distinct IPs that “hit” the package over the last 12 months. Core packages (i.e. the BiocInstaller package + packages that get installed the first time biocLite() is called with no arguments) are reported in bold.


Top 75

1BiocInstaller (151237)
2BiocGenerics (114012)
3IRanges (103795)
4Biobase (103166)
5AnnotationDbi (92574)
6zlibbioc (71503)
7GenomeInfoDb (69707)
8limma (62384)
9Biostrings (61449)
10GenomicRanges (59198)
11XVector (55854)
12annotate (52658)
13genefilter (46894)
14Rsamtools (45567)
15biomaRt (44311)
16graph (42236)
17rtracklayer (41594)
18GenomicFeatures (39686)
19preprocessCore (38285)
20affy (38005)
21BSgenome (36580)
22BiocParallel (36207)
23S4Vectors (36183)
24GenomicAlignments (34141)
25affyio (33636)
26geneplotter (31398)
27edgeR (29379)
28multtest (27099)
29RBGL (26408)
30DESeq2 (23611)
31GEOquery (23487)
32Rgraphviz (23338)
33DESeq (21988)
34impute (21928)
35VariantAnnotation (21464)
36biovizBase (21213)
37rhdf5 (17462)
38gcrma (16528)
39Gviz (16246)
40qvalue (15431)
41GSEABase (15365)
42ShortRead (14702)
43vsn (14451)
44Category (14278)
45AnnotationForge (14123)
46cummeRbund (13315)
47affyPLM (12830)
48GOstats (12779)
49siggenes (11888)
50ggbio (11423)
51illuminaio (11224)
52DNAcopy (10640)
53simpleaffy (10506)
54oligoClasses (10378)
55marray (10116)
56affxparser (9905)
57minfi (9400)
58oligo (9363)
59topGO (8943)
60annaffy (8759)
61bumphunter (8657)
62lumi (8442)
63EBImage (8304)
64mzR (8245)
65KEGGREST (8240)
66methylumi (8137)
67sva (8115)
68xcms (7604)
69DynDoc (7554)
70flowCore (7276)
71DEXSeq (7166)
72KEGGgraph (7159)
73pcaMethods (7015)
74beadarray (6548)
75widgetTools (6479)

All Software packages

MonthNb of distinct IPsNb of downloads
Apr/201439965777391
May/201438374830827
Jun/201436391728039
Jul/201436901655951
Aug/201436749681886
Sep/201448463788990
Oct/201444826826504
Nov/201432723816796
Dec/201430628721192
Jan/2015317201091019
Feb/201531955750997
Mar/20152994619
All months2762808674211

A

a4 (2258)
a4Base (2424)
a4Classif (2256)
a4Core (2423)
a4Preproc (2434)
a4Reporting (2252)
ABarray (2183)
ABSSeq (1662)
acepack (1)
aCGH (2937)
ACME (2130)
ADaCGH2 (2049)
adSplit (2020)
AdvancedR (1)
AdvancedR2011 (1)
AdvancedR2011Data (1)
affxparser (9905)
affy (38005)
affycomp (3078)
AffyCompatible (2268)
affyContam (2095)
affycoretools (5398)
affydata (1)
AffyExpress (2280)
affyILM (1988)
affyio (33636)
affylmGUI (3168)
affyPara (1992)
affypdnn (2431)
affyPLM (12830)
affyqcreport (2)
affyQCReport (5749)
AffyRNADegradation (1969)
AffyTiling (2050)
AGDEX (1916)
Agi4x44PreProcess (746)
agilp (2352)
agimicrorna (1)
AgiMicroRna (2465)
AIMS (35)
ALDEx2 (607)
AllelicImbalance (1790)
alsace (1554)
altcdfenvs (2082)
ampliQueso (1705)
AnalysisPageServer (11)
annaffy (8759)
AnnBuilder (32)
annmap (968)
annotate (52658)
annotation (206)
AnnotationDbi (92574)
AnnotationForge (14123)
AnnotationFuncs (2086)
AnnotationHub (3033)
annotationTools (2700)
anota (2080)
antiProfiles (1830)
apcluster (1)
apComplex (2140)
applera (1)
aroma.light (5151)
ArrayExpress (4446)
ArrayExpressHTS (1215)
arrayMagic (14)
arrayMvout (1934)
arraymvout (1)
arrayQCplot (2)
arrayQuality (2578)
arrayQualityMetrics (5283)
arrays (315)
ArrayTools (2447)
ArrayTV (1766)
ARRmNormalization (1749)
ASEB (1841)
ASGSCA (573)
asmn (1541)
ASSET (1737)
ASSIGN (1532)
AtlasRDF (1565)
attract (1883)

B

BAC (1852)
BADER (1776)
BAGS (1671)
ballgown (783)
base64enc (1)
BaseSpaceR (1805)
Basic4Cseq (1706)
BatchJobs (1)
BayesPeak (2930)
baySeq (4369)
BBmisc (1)
BCRANK (2142)
beadarray (6548)
beadarraySNP (2093)
BeadDataPackR (5966)
beaddatapackr (1)
BeadExplorer (3)
BEAT (1514)
betr (2047)
bgafun (1934)
BGmix (1091)
bgx (1914)
BHC (2234)
BicARE (1956)
BiGGR (1762)
bigmemoryExtras (1141)
bioassayR (2023)
Biobase (103166)
biobase (1)
BiocCaseStudies (1946)
BiocCheck (2179)
biocDatasets (41)
BiocGenerics (114012)
biocGraph (2072)
BiocInstaller (151237)
biocinstaller (3)
BiocParallel (36207)
BiocStyle (4747)
biocViews (3013)
bioDist (4298)
biomaRt (44311)
BioMVCClass (2054)
biomvRCNS (1790)
BioNet (3086)
BioSeqClass (1977)
Biostrings (61449)
biosvd (1551)
biovizBase (21213)
BiRewire (1769)
birta (1858)
birte (5)
BiSeq (2218)
bitops (1)
BitSeq (2388)
blima (646)
blimaTestingData (3)
BRAIN (2172)
BrainStars (1859)
brew (1)
bridge (1883)
BridgeDbR (559)
BSgenome (36580)
bsseq (2622)
BubbleTree (2)
BufferedMatrix (1957)
bufferedmatrix (1)
BufferedMatrixMethods (1886)
bumphunter (8657)
BUS (1793)

C

CAFE (1516)
CAGEr (1999)
CALIB (1806)
CAMERA (3402)
cancerclass (1797)
CancerMutationAnalysis (1889)
Cardinal (11)
casper (1821)
Category (14278)
categoryCompare (1834)
CausalR (1)
ccrepe (1482)
cellGrowth (1789)
cellhts (1)
cellHTS (1881)
cellHTS2 (2744)
CellNOptR (2204)
CexoR (1652)
CFAssay (536)
CGEN (1971)
CGHbase (2456)
CGHcall (2332)
cghcall (1)
cghMCR (2823)
CGHnormaliter (1821)
CGHregions (1885)
ChAMP (2832)
charm (2086)
checkmate (1)
ChemmineOB (2334)
ChemmineR (3607)
chemminer (3)
chimera (2775)
chipenrich (1640)
ChIPpeakAnno (5790)
ChIPQC (1743)
ChIPseeker (2141)
chipseq (3903)
ChIPseqR (2027)
ChIPsim (1972)
ChIPXpress (973)
chopsticks (2039)
chroGPS (1732)
chromDraw (6)
ChromHeatMap (1902)
ChromoViz (1)
cisPath (1728)
ClassifyR (574)
cleanUpdTSeq (1550)
cleaver (1947)
clippda (1744)
clipper (1940)
Clomial (1417)
Clonality (1735)
clonotypeR (1552)
clst (1708)
clstutils (1654)
clusterProfiler (3528)
clusterprofiler (1)
clusterStab (1911)
CMA (2386)
cn.farms (1730)
cn.mops (3029)
CNAnorm (1869)
CNEr (1725)
CNORdt (1700)
CNORfeeder (1643)
CNORfuzzy (1713)
CNORode (1756)
CNTools (2094)
cnvGSA (1713)
CNVrd2 (1604)
CNVtools (1922)
cnvtools (1)
cobindR (1573)
CoCiteStats (1843)
codelink (1816)
CODEX (30)
CoGAPS (807)
coGPS (1629)
COHCAP (1599)
colorspace (1)
coMET (15)
COMPASS (1451)
compcodeR (1647)
compEpiTools (582)
CompGO (1461)
ConsensusClusterPlus (3049)
convert (2989)
copa (1884)
COPDSexualDimorphism (1377)
copynumber (2025)
CopyNumber450k (1450)
CoRegNet (567)
Cormotif (1674)
CorMut (1731)
coRNAi (1690)
CORREP (1745)
cosmiq (572)
cosmo (116)
cosmoGUI (142)
COSNet (504)
CoverageView (923)
cpvSNP (4)
cqn (2380)
CRImage (1947)
CRISPRseek (1634)
crlmm (3123)
CSAR (2110)
csaw (568)
CSSP (1554)
ctc (4043)
cummeRbund (13315)
cummerbund (1)
customProDB (1664)
cycle (1775)

D

dagLogo (1527)
dama (2)
daMA (1678)
DART (1673)
DASiR (1650)
DAVIDQuery (2240)
DBChIP (1895)
DBI (1)
ddCt (2212)
ddgraph (1726)
DECIPHER (1990)
DeconRNASeq (1711)
DEDS (1763)
deepSNV (1896)
DEGraph (2001)
DEGreport (576)
DEGseq (3579)
degseq (1)
deltaGseg (1555)
derfinder (618)
derfinderData (4)
derfinderHelper (611)
derfinderPlot (547)
DESeq (21988)
DESeq2 (23611)
DEXSeq (7166)
dexus (1687)
DFP (1697)
dichromat (1)
DiffBind (3908)
diffGeneAnalysis (1802)
digest (1)
diggitdata (4)
DirichletMultinomial (2167)
dks (1627)
DMRcate (1594)
DMRforPairs (1411)
DNAcopy (10640)
DNaseR (1636)
domainsignatures (1793)
DOQTL (638)
DOSE (3953)
DriverNet (1691)
DrugVsDisease (1735)
DSS (2037)
DTA (1639)
dualKS (1556)
DupChecker (545)
dyebias (1711)
DynDoc (7554)
dyndoc (1)

E

EasyqpcR (1899)
easyRNASeq (4105)
EBarrays (2446)
EBcoexpress (1768)
EBImage (8304)
EBSeq (3364)
EBSeqHMM (517)
ecolitk (1776)
EDASeq (3243)
edd (45)
EDDA (1509)
edger (1)
edgeR (29379)
eiR (1019)
eisa (2069)
ELBOW (1386)
EnrichmentBrowser (580)
ensemblVEP (2361)
ENVISIONQuery (1696)
epigenomix (1670)
epivizr (1888)
eQTL (22)
erccdashboard (566)
ExiMiR (1779)
exomeCopy (2299)
exomePeak (1680)
exonfindR (255)
exonmap (100)
explorase (1279)
ExpressionView (1738)
expressionview (1)
externalVector (220)

F

fabia (2244)
facopy (508)
facopy.annot (5)
factDesign (1948)
fail (1)
farms (1878)
fastLiquidAssociation (1210)
fastseg (1752)
fbat (34)
fdrame (1774)
FEM (541)
ffpe (1683)
FGNet (1826)
flagme (1779)
flipflop (1567)
flowBeads (1532)
flowBin (1396)
flowcatchR (536)
flowCHIC (524)
flowCL (1414)
flowClean (573)
flowClust (2827)
flowCore (7276)
flowCyBar (1392)
flowDensity (642)
flowFit (1536)
flowFlowJo (1849)
flowFP (1926)
flowMap (1602)
flowMatch (1395)
flowMeans (2165)
flowMerge (2025)
flowPeaks (1822)
flowPhyto (1660)
flowPlots (1762)
flowq (1)
flowQ (1400)
flowQB (1645)
FlowSOM (17)
flowStats (3880)
flowTrans (1866)
flowType (1882)
flowUtils (2088)
flowViz (5462)
flowworkspace (1)
flowWorkspace (4811)
fmcsR (2302)
focalCall (502)
fOptions (1)
foreach (1)
Formula (1)
FourCSeq (557)
FRGEpistasis (1352)
frma (2573)
frmaTools (1900)
FunciSNP (1851)

G

gaga (1902)
gage (4573)
gaggle (1707)
gaia (1669)
gaucho (1385)
gCMAP (1775)
gCMAPWeb (1604)
gcrma (16528)
gdsfmt (772)
geecc (497)
genArise (1695)
GENE.E (1938)
gene2pathway (172)
GeneAnswers (3824)
GeneExpressionSignature (1786)
genefilter (46894)
genefu (2260)
GeneGA (1035)
GeneGroupAnalysis (183)
GeneMeta (2189)
GeneNetworkBuilder (1727)
GeneOverlap (1475)
geneplotter (31398)
GeneR (56)
geneRecommender (1869)
GeneRegionScan (1676)
generegulation (62)
GeneRfold (28)
geneRxCluster (1377)
GeneSelectMMD (1693)
GeneSelector (1995)
GeneSpring (39)
geNetClassifier (1711)
GeneticsBase (29)
GeneticsDesign (1732)
GeneticsPed (1894)
GeneTraffic (55)
GeneTS (3)
genoCN (1706)
genomation (23)
GenomeGraphs (3623)
genomeinfodb (1)
GenomeInfoDb (69707)
genomeIntervals (4384)
genomes (1969)
GenomicAlignments (34141)
GenomicFeatures (39686)
genomicfeatures (1)
GenomicFiles (1717)
GenomicInteractions (525)
GenomicRanges (59198)
GenomicTuples (544)
Genominator (2173)
genoset (2572)
GenoView (504)
GEOmetadb (2716)
GEOquery (23487)
geoquery (1)
GEOsubmission (1688)
gespeR (6)
GEWIST (1582)
gff3Plotter (4)
GGBase (3148)
ggbio (11423)
GGtools (2417)
ggtree (53)
girafe (2019)
GLAD (2568)
GlobalAncova (2155)
globaltest (4151)
gmapR (1010)
GOexpress (621)
GOFunction (2003)
goProfiles (2291)
goprofiles (2)
GOSemSim (4697)
gosemsim (1)
goseq (4890)
GOSim (2056)
gostats (1)
GOstats (12779)
GOsummaries (641)
GOTHiC (1384)
goTools (2365)
gpls (2420)
gprege (1600)
gQTLBase (16)
gQTLstats (16)
graph (42236)
GraphAlignment (1728)
GraphAT (1701)
graphite (3134)
GraphPAC (1578)
GRENITS (1744)
GreyListChIP (2)
grndata (4)
groHMM (528)
GSAR (599)
GSBenchMark (4)
GSCA (1403)
gseabase (1)
GSEABase (15365)
GSEAlm (2216)
GSReg (519)
GSRI (1716)
GSVA (2421)
Gviz (16246)
gwascat (2038)
GWASTools (3051)

H

h5vc (1690)
hapFabia (1643)
Harshlight (1732)
HCsnip (1602)
HDTD (548)
Heatplus (6452)
HELP (1680)
HEM (1672)
hexbin (149)
hiAnnotator (575)
HIBAG (2)
highthroughputassays (14)
HilbertVis (2751)
HilbertVisGUI (1395)
hiReadsProcessor (503)
HiTC (1819)
Hmisc (1)
HMMcopy (1885)
hopach (3010)
hpar (1891)
HSMMSingleCell (3)
HTqPCR (2819)
HTSanalyzeR (2095)
HTSeqGenie (400)
htseqtools (2)
htSeqTools (1992)
HTSFilter (1878)
HybridMTest (1595)
hyperdraw (1942)
hypergraph (2499)

I

iASeq (1748)
iBBiG (1674)
ibh (1575)
iBMQ (1545)
Icens (3229)
iChip (1654)
iClusterPlus (4678)
IdeoViz (518)
idiogram (1744)
IdMappingAnalysis (1586)
IdMappingRetrieval (1616)
iFlow (153)
illuminaio (11224)
imageHTS (1822)
IMPCdata (477)
impute (21928)
INPower (1321)
inSilicoDb (2323)
inSilicoMerging (2315)
intansv (1611)
interactiveDisplay (3573)
interactiveDisplayBase (1861)
IntermediateSequenceAnalysis2013 (8)
inveRsion (1589)
inversion (1)
iontree (1609)
iPAC (1679)
IPPD (1857)
IRanges (103795)
iranges (1)
iSeq (1681)
isobar (2092)
IsoGeneGUI (1710)
iSPlot (1)
ITALICS (1660)
iterativeBMA (1665)
iterativeBMAsurv (1639)
iterators (1)
IVAS (1)

J

jmosaics (1571)
joda (1635)

K

KCsmart (1694)
kebabs (583)
KEGGgraph (7159)
keggorth (18)
keggorthology (1943)
KEGGprofile (2214)
KEGGREST (8240)
KEGGSOAP (360)

L

labeling (1)
lapmix (1703)
latticeExtra (1)
LBE (1970)
les (1714)
limma (62384)
limmaGUI (2879)
LiquidAssociation (1701)
liquidassociation (1)
lmdme (1660)
LMGene (1887)
logicFS (2238)
logitt (1)
logitT (1686)
lol (1642)
LowMACAAnnotation (4)
LowMACAdb (4)
LPE (2063)
LPEadj (1661)
lpNet (1580)
lumi (8442)
LVSmiRNA (1766)

M

M3D (546)
maanova (2412)
macat (1694)
maCorrPlot (1631)
maDB (257)
madb (1)
made4 (4076)
maigesPack (1679)
MAIT (585)
makecdfenv (3270)
makePlatformDesign (37)
MANOR (1685)
manta (1650)
MantelCorr (1676)
mAPKL (5)
mAPKLData (4)
maPredictDSC (1527)
marray (10116)
maSigPro (2568)
maskBAD (1602)
MassArray (1754)
massiR (1366)
MassSpecWavelet (3179)
matchBox (1606)
matchprobes (93)
MBAmethyl (483)
MBASED (530)
MBCB (1690)
mBPCR (1641)
mcaGUI (1669)
MCRestimate (1803)
mdgsa (11)
mdqc (1825)
MeasurementError.cor (1578)
MEDIPS (2419)
MEDME (1691)
MEIGOR (502)
MergeMaid (2245)
MeSH.AOR.db (3)
MeSH.db (3)
MeSH.PCR.db (3)
MeSHDbi (1604)
meshr (1417)
MeSHSim (10)
messina (1341)
metaArray (2219)
Metab (528)
metabomxtr (487)
metagene (517)
metagenomeSeq (2989)
metahdep (1636)
metaMS (1497)
metaSeq (1527)
metaseqR (1476)
methVisual (1751)
methyAnalysis (2324)
MethylAid (608)
MethylMix (534)
methylMnM (1554)
methylPipe (675)
MethylSeekR (1794)
methylumi (8137)
Mfuzz (3665)
mfuzz (1)
MGFM (481)
mgsa (1808)
MiChip (1630)
microRNA (2355)
MIMOSA (1374)
MineICA (1589)
minet (4045)
minfi (9400)
MinimumDistance (1638)
MiPP (1668)
MiRaGE (1642)
miRNApath (1905)
miRNAtap (515)
Mirsynergy (1368)
missMethyl (592)
mitoODE (1401)
MLInterfaces (3002)
MLP (1690)
MLSeq (1537)
MMDiff (1677)
mmnet (1447)
MmPalateMiRNA (1696)
monocle (852)
MoPS (528)
mosaics (1959)
MotifDb (2800)
motifRG (1735)
motifStack (2640)
MotIV (2950)
MPFE (466)
mQTL.NMR (511)
MSGFgui (579)
MSGFplus (605)
MSIseqData (7)
msmsEDA (1514)
msmsTests (1483)
MSnbase (3548)
MSnID (580)
msQC (55)
MSstats (1892)
MUGAExampleData (3)
Mulcom (1721)
MultiMed (486)
multiscan (1624)
multtest (27099)
munsell (1)
MVCClass (1806)
mvGST (502)
mygene (667)
mzID (2585)
mzR (8245)

N

NarrowPeaks (1683)
ncdfFlow (4195)
NCIgraph (2053)
neaGUI (1626)
nem (1777)
netbenchmark (1)
netbiov (533)
nethet (7)
NetPathMiner (1436)
netresponse (1633)
NetSAM (1521)
networkBMA (1656)
NGScopy (484)
NGScopyData (4)
nnNorm (1654)
NOISeq (3409)
nondetects (1374)
NormqPCR (2104)
npGSEA (1415)
NTW (1595)
nucleR (1770)
nucler (1)
nudge (1598)
NuPoP (1665)

O

occugene (1638)
OCplus (1801)
OGSA (1)
oligo (9363)
oligoClasses (10378)
oligoclasses (1)
OLIN (1745)
OLINgui (1623)
omicade4 (1690)
OmicCircos (2210)
OncoSimulR (383)
oneChannelGUI (2455)
ontoCAT (1803)
ontoTools (43)
openCyto (1828)
oposSOM (612)
OrderedList (2608)
org.Hs.eg.db (2)
org.MeSH.Aca.db (3)
org.MeSH.Atu.K84.db (3)
org.MeSH.Bsu.168.db (3)
org.MeSH.Hsa.db (3)
org.MeSH.Syn.db (3)
OrganismDbi (5786)
OSAT (1584)
OTUbase (1771)
OutlierD (1756)

P

PAA (503)
PADOG (1661)
paircompviz (1495)
pairseqsim (3)
pamr (50)
PAnnBuilder (1808)
panp (1833)
PANR (1600)
PAPi (1613)
parglms (2)
parody (2165)
pathifier (1553)
PathNet (1610)
pathRender (1728)
pathview (5736)
PatientGeneSets (51)
paxtoolsr (573)
Pbase (534)
pcaGoPromoter (1862)
pcaMethods (7015)
pcot2 (1632)
PCpheno (1631)
pdInfoBuilder (2459)
pdmclass (1686)
PECA (1405)
pepDat (4)
pepStat (481)
pepXMLTab (485)
PGSEA (2263)
pgUtils (327)
phenoDist (1585)
phenoTest (1782)
PhenStat (1361)
phyloseq (5422)
piano (2560)
pickgene (1632)
PICS (2247)
PING (1713)
pint (1682)
pkgDepTools (1939)
plateCore (1715)
plethy (1506)
plgem (1677)
plier (2922)
PLPE (1689)
plrs (1575)
plw (1614)
plyr (1)
polyester (555)
Polyfit (521)
ppiStats (1740)
prada (3354)
prebs (1575)
PREDA (1659)
predictionet (968)
preprocessCore (38285)
proBAMr (429)
PROcess (2278)
procoil (1584)
ProCoNA (1502)
pRoloc (1719)
pRolocdata (1)
pRolocGUI (553)
PROMISE (1599)
PROPER (7)
prot2D (1551)
proteinProfiles (1491)
proteoQC (541)
ProtGenerics (1)
PSEA (481)
PSICQUIC (1733)
puma (1950)
pvac (1639)
pvca (1751)
Pviz (538)
pvxmlrpclibs (4)
PWMEnrich (2004)

Q

qcmetrics (1418)
QDNAseq (1568)
qpcrNorm (1757)
qpgraph (2718)
qrqc (2044)
QUALIFIER (1552)
quantro (516)
quantsmooth (3575)
QuartPAC (5)
QuasR (3308)
qusage (1505)
qvalue (15431)

R

r3Cseq (1719)
R453Plus1Toolbox (1756)
rain (523)
rama (1842)
RamiGO (2222)
ramigo (1)
randpack (1)
randPack (1590)
RankProd (3989)
Rariant (1353)
RbcBook1 (1770)
RBGL (26408)
rbioinf (1)
RBioinf (1805)
rBiopaxParser (1791)
Rbowtie (3335)
rbsurv (1708)
Rcade (1591)
RCASPAR (1587)
Rchemcpp (1452)
RchyOptimyx (1727)
RColorBrewer (1)
Rcpi (1908)
Rcpp (1)
RCurl (1)
RCytoscape (3865)
RDAVIDWebService (2510)
Rdbi (38)
RdbiPgSQL (19)
Rdisop (2066)
RDRToolbox (2220)
ReactomePA (2585)
ReadqPCR (2140)
reb (1625)
RedeR (2216)
REDseq (1755)
RefNet (1344)
RefPlus (1677)
regionReport (499)
Repitools (3013)
ReportingTools (5631)
ReQON (1632)
Resourcerer (1249)
rflowcyt (37)
rfPred (1462)
rGADEM (3328)
RGalaxy (1701)
Rgraphviz (23338)
rGREAT (1)
RGSEA (566)
rgsepd (6)
rhdf5 (17462)
rHVDM (1606)
riboSeq (48)
riboSeqR (531)
ringo (1)
Ringo (3459)
Rintact (25)
RIPSeeker (1808)
Risa (1640)
RLMM (1615)
RMAGEML (8)
rmagpie (1)
Rmagpie (1630)
RMAPPER (1180)
RMassBank (1733)
rMAT (1068)
RmiR (1924)
RNAinteract (1646)
RNAither (1738)
rnaither (1)
rnaseqGene (238)
rnaSeqMap (1849)
RNASeqPower (1847)
RnaSeqSampleSize (9)
RnaSeqSampleSizeData (4)
RnBeads (4)
RnBeads.hg19 (4)
Rnits (496)
roar (1359)
ROC (5078)
Roleswitch (1513)
Rolexa (1769)
rols (1939)
ROntoTools (1676)
RPA (1786)
RpsiXML (1893)
rpx (1706)
Rqc (520)
rqubic (1688)
rRDP (490)
rRDPData (5)
Rredland (7)
RRHO (1537)
rsamtools (3)
Rsamtools (45567)
rsbml (2189)
rSFFreader (979)
RSNPper (13)
RSQLite (1)
Rsubread (3620)
RSVSim (1647)
rTANDEM (2006)
RTCA (1728)
RTN (1666)
RTools4TB (27)
RTopper (1639)
rtracklayer (41594)
Rtreemix (1637)
rTRM (1533)
rTRMui (1470)
Ruuid (50)
RUVnormalize (522)
RUVnormalizeData (4)
RUVSeq (1025)
RWebServices (333)

S

S4Vectors (36183)
safe (2007)
SAGElyzer (1)
sagenhaft (1627)
SAGx (2031)
sagx (1)
SamSPECTRAL (1750)
sangerseqR (1853)
SANTA (1537)
sapFinder (1375)
saps (13)
savR (1277)
SBMLR (1724)
scales (1)
SCAN.UPC (1993)
ScISI (1785)
scsR (1299)
SeattleIntro2010 (3)
segmentSeq (1753)
SemDist (482)
SemSim (13)
sendmailR (1)
seq2pathway (2)
seq2pathway.data (4)
SeqArray (1691)
seqbias (1824)
seqCNA (1536)
SeqGSEA (2273)
seqLogo (6180)
Seqnames (4)
seqPattern (5)
seqplots (600)
seqTools (523)
SequenceAnalysis (3)
SequenceAnalysisData (26)
SeqVarTools (1535)
SGSeq (500)
shinyMethyl (664)
shinyMethylData (4)
shinyTANDEM (1533)
ShortRead (14702)
sidap (3)
sigaR (1670)
SigCheck (492)
SigFuge (1496)
siggenes (11888)
sigPathway (2234)
SIM (1685)
SimBindProfiles (1417)
simpleaffy (10506)
simulatorAPMS (38)
simulatorZ (479)
sincell (18)
sizepower (1922)
SJava (394)
SLGI (1685)
slgi (1)
SLqPCR (1888)
SMAP (1618)
SNAGEE (1477)
snapCGH (2165)
snm (1864)
SNPchip (3237)
snpMatrix (241)
SNPRelate (1070)
snpStats (5704)
SomatiCA (1584)
SomaticSignatures (1655)
SpacePAC (1467)
spade (2196)
specL (496)
SpeCond (1655)
SPEM (1479)
SPIA (3156)
spikeLI (1572)
spkTools (1590)
splicegear (1650)
spliceR (2067)
spliceSites (1478)
SplicingGraphs (1645)
splots (2812)
spotSegmentation (1766)
SQUADD (1535)
SRAdb (3998)
sRAP (1707)
sscore (1588)
sSeq (1516)
ssize (1985)
SSPA (1793)
ssviz (537)
stam (8)
STAN (523)
staRank (1541)
Starr (1748)
STATegRa (511)
stepNorm (1598)
stepwiseCM (1560)
Streamer (1717)
STRINGdb (1906)
stringr (1)
StudentGWAS (2)
supraHex (1812)
survcomp (3754)
Sushi (1772)
sva (8115)
SwimR (1385)
switchBox (489)
synapter (1831)
systemPipeR (729)

T

targetPredictor (4)
targetPredictor.db (4)
targetPredictorTemp (4)
TargetScore (1513)
TargetSearch (1723)
TCC (2039)
TDARACNE (1715)
TEQC (1780)
ternarynet (1524)
tfbstools (1)
TFBSTools (2022)
tigre (1689)
tilingArray (2308)
timecourse (2104)
TitanCNA (1446)
tkWidgets (6399)
ToPASeq (526)
topGO (8943)
tracktables (481)
trackViewer (1485)
tRanslatome (1627)
TransView (1617)
triform (1526)
trigger (1623)
trio (1683)
triplex (1571)
TRONCO (9)
TSCAN (471)
tspair (1768)
TSSi (1623)
TurboNorm (1647)
tweeDEseq (1856)
twilight (2738)
typeinfo (1)
TypeInfo (1614)

U

UNDO (1345)
unifiedWMWqPCR (1346)
UniProt.ws (2153)

V

VanillaICE (1908)
VariantAnnotation (21464)
VariantFiltering (1627)
variants (138)
VariantTools (937)
vbmp (2077)
Vega (1601)
VegaMC (1622)
viper (1397)
virtualArray (1626)
vsn (14451)
vtpnet (1484)

W

wateRmelon (3294)
wavClusteR (584)
waveTiling (1540)
weaver (2012)
webbioc (1696)
WES.1KG.WUGSC (4)
widgetTools (6479)

X

xcms (7604)
XDE (1624)
xmapbridge (1592)
xmapcore (146)
XML (1)
xps (2334)
XVector (55854)

Y

yaqcaffy (1963)

Z

zebrafishRNASeq (6)
zlibbioc (71503)